Postrada en una montaña rocosa, dirigida a la gente que hablaba Keresan en los pueblos de Acoma, de Santo Domingo, y de Cohití, esta iglesia fue construida con piedra y adobe en 1701, después de los trastornos causados por la Revuelta de los Pueblos en 1680.
El Pueblo Isleta se había establecido antes de la ocupación en 1598 de Nuevo Mexico por los españoles y fue quemado durante los diversos intentos de reocupar la región por los españoles después de la Revuelta de los Pueblos en 1680.
Jesuitas españoles fundaron San Cayetano de Calabazas en 1756 después de reorganizar sus asentamentos por motivo de la Revuelta Pima en 1751.