Fundada en 1720, esta misión fue nombrada así por San José y por el Marqués de San Miguel de Aguayo, el governador de la Provincia de Coahuila y Texas en aquel tiempo. La misión fue construida a las orillas del rio San Antonio y fundada por el Padre Antonio Margil de Jesús.
Ésta es la misión más antigua descubierta hasta ahora en el Texas Español. También es el sitio Europeo más antiguo descubierto en Texas del Este y el sitio más antiguo hasta ahora descubierto que llevaba el nombre de Tejas.
La Misión fue fundada por misioneros Franciscanos en 1722. De la misma manera que el asentamiento francés en Matagorda Bay, este fuerte español tampoco duró mucho, pues no se había logrado cosechar en abundancia ni atraer nativos inconversos.
La Misión Ysleta fue construida en 1744 por los Indios Tigua administrados por los Franciscanos. Fue construída en gran parte para servir a la comunidad de los Indios Tigua, quienes huyeron a Nuevo México durante la Revueltas de los Pueblos.
El Pueblo de Santa Clara Pueblo fue visitado por priera vez en 1541 como parte de la expedición de Francisco Vásquez de Coronado. Una misión fue establecida en 1628 como visita a el Pueblo de San Juan.
La misión fue construida entre 1615 y 1626 como parte de las otras misiones para los Pueblos Piro que quedaban por el Camino Real.
San Juan Pueblo es conocido como el primer asentamiento español en el Suroeste de Estados Unidos. Después de la recolonización de Nuevo México por los españoles en 1692, un complejo misional fue construido para servir al Pueblo Ohkay Owingeh.
Postrada en una montaña rocosa, dirigida a la gente que hablaba Keresan en los pueblos de Acoma, de Santo Domingo, y de Cohití, esta iglesia fue construida con piedra y adobe en 1701, después de los trastornos causados por la Revuelta de los Pueblos en 1680.
La misión de San Ildefonso se convirtió en el centro de actividad franciscana en el norte cuando primero se construyó. La iglesia fue quemada en la revuelta de 1696 y reconstruida posteriormente para los españoles.
Continuamente ocupada desde la llegada de los españoles en 1540, la Misión fue fundada por el Franciscano Juan Ramírez en 1629 y fue afectada por la Revuelta de los Pueblos en 1680. Misión San Estévan del Rey es la iglesia de construcción europea más antigua en Nuevo México.
San Buenaventura de Cochiti fue construída en 1628, siguiendo los prototipos de la época y ubicación:paredes de adobe, planta rectángular y un techo hecho con vigas de madera.
El Pueblo Isleta se había establecido antes de la ocupación en 1598 de Nuevo Mexico por los españoles y fue quemado durante los diversos intentos de reocupar la región por los españoles después de la Revuelta de los Pueblos en 1680.
La Misión de Nuestra Señora de la Asunción en Zia se encuentra sobre una mesa con vista al este. Zía fuel el asentamiento principal de la provincia de Cumanes. Fray Alonso de Lugo estuvo a cargo de Zia en 1598 y la primer iglesia fue construida al poco tiempo.
Fundada por el Padre Kino, esta fue originalmente una misión Jesuita, la cual fue posteriormente tomada por los Franciscanos quienes la reconstruyeron alrededor de 1800. La misión estuvo envuelta en actividades como minería, fundición, ganadería y agricultura.
La Misión fue iniciada por el padre Antonio de San Buenaventura y Olivares en 1716, este Hito Historico Nacional y Estatal fue originalmente situado al oeste del manantial de San Pedro.