Fundada en 1720, esta misión fue nombrada así por San José y por el Marqués de San Miguel de Aguayo, el governador de la Provincia de Coahuila y Texas en aquel tiempo. La misión fue construida a las orillas del rio San Antonio y fundada por el Padre Antonio Margil de Jesús.
La Misión fue fundada por misioneros Franciscanos en 1722. De la misma manera que el asentamiento francés en Matagorda Bay, este fuerte español tampoco duró mucho, pues no se había logrado cosechar en abundancia ni atraer nativos inconversos.
La Misión Ysleta fue construida en 1744 por los Indios Tigua administrados por los Franciscanos. Fue construída en gran parte para servir a la comunidad de los Indios Tigua, quienes huyeron a Nuevo México durante la Revueltas de los Pueblos.
El Pueblo de Santa Clara Pueblo fue visitado por priera vez en 1541 como parte de la expedición de Francisco Vásquez de Coronado. Una misión fue establecida en 1628 como visita a el Pueblo de San Juan.
La primera iglesia en el Pueblo de Pecos fue construida probablemente por el Franciscano Fray Pedro Zambrano Ortiz en 1619. La gente del pueblo no quería la construcción de una iglesia demasiado cerca a sus viviendas.
Después del restablecimiento de las misiones en la región, los Zunis se unieron a las luchas armadas del pueblo en 1680 destruyendo a la Misión de la Purísima Concepción, Tanto los Zunis como los españoles abandonaron Hawikuh por completo, sin regresar nunca más.
Fundada por el Padre Kino, esta fue originalmente una misión Jesuita, la cual fue posteriormente tomada por los Franciscanos quienes la reconstruyeron alrededor de 1800. La misión estuvo envuelta en actividades como minería, fundición, ganadería y agricultura.
San Xavier del Bac se encuentra localizada al Suroeste de la ciudad de Tucsón, Arizona. Fue fundada en 1692 por el Padre Eusebio Francisco Kino.